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Alguns dels majors impactes ambientals són:

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Pesca ilegal de arrastre:
La pesca de arrastre, es una de las artes más impactantes que existen, pues producen
destrozos en casi todos los tipos de fondo sobre los que arrastran.

Dragados ilegales:
La extracción ilegal de arena es otro problema importante para las praderas de Posidonia.
La arena se extrae para regeneración de playas, para invernaderos o la construcción.

Vertidos (aguas sucias, contaminación difusa por abonos, plantas químicas, térmicas...):
Los vertidos de aguas sucias de las poblaciones costeras frecuentemente solo son
tratados por decantación de sólidos. Por tanto las aguas vertidas son ricas en materia
orgánica y nutrientes disueltos, y como se ha explicado antes, degradan el ambiente por
un proceso de eutrofización.

Acuicultura:
Los restos de comida y deyecciones de los peces engordados en jaulas son vertidos ricos
en materia orgánica, nitrógeno y fósforo, similar al de las aguas sucias de las poblaciones
costeras. La sombra de las jaulas también puede afectar a las plantas y algas del fondo.

Construcciones costeras:
Hoy en día, más del 70% de la población mundial vive en la costa. Esto implica una gran
presión sobre el medio litoral.
La construcción de edificios, carreteras y paseos marítimos, cortan a menudo la
alimentación de arena de las playas, iniciando su erosión y la de las praderas marinas.

Fondeo libre intensivo:
Cuando un barco lanza el ancla para fondear sobre una pradera de Posidonia, puede
arrancar muchos haces de planta durante la maniobra, y también al levar anclas. .
Si el ancla garrea, o cuando el viento rola, haciendo al barco girar alrededor del ancla, la
cadena se arrastra por el fondo, arrancando mas haces.

Algas invasoras:

Alrededor de una décima parte de las especies exóticas tienen un comportamiento
invasor, que altera los ecosistemas autóctonos. En la costa mediterránea, dos algas
tropicales del género Caulerpa tienen comportamiento invasor (Caulerpa taxifolia y
Caulerpa racemosa).
Caulerpa taxifolia fue introducida accidentalmente por el acuario de Mónaco y tuvo al
principio un avance muy agresivo, pero luego ha perdido virulencia, se cree que al tener
muy poca diversidad genética, sus poblaciones han sido controladas por algún patógeno.
Caulerpa racemosa penetró en los 90 por en canal de Suez, y se ha ido desplazando hacia
el oeste. Se encuentra ya en todo el levante español. Sus poblaciones tienen más
diversidad genética que su especie hermana.

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